微生物菌剂是指目标微生物（有效菌）经过工业化生产扩繁后，利用多孔的物质作为吸附剂（如草炭、蛭石），吸附菌体的发酵液加工制成的活菌制剂，生产中常见的微生物菌剂有以下几种！
【1】枯草芽孢杆菌：对果树、瓜类、茄果类、姜、马铃薯、麻山药、三七、人参等作物的枯黄萎病、根腐病及马铃薯晚疫病、香蕉巴拿马病等土传病害有很好的防治效果。
【2】侧孢短小芽孢杆菌：可促进植物根部有益菌大量生长，抑制病原菌繁殖，促进植物根系生长，增强根系吸收能力，并能活化土壤养分（固氮、解磷、解钾），提高作物产量，改善品质。
【3】胶冻样类芽孢杆菌：解钾，释放出可溶磷、钾元素及钙、硫、镁、铁、锌、钼、锰等中的微量元素
【4】多粘类芽孢杆菌：多粘类芽孢杆菌对细菌性土传病害―植物青枯病具有很好的防治效果。
【5】解淀粉芽孢杆菌：具有很强的抗病抑菌作用，自身可分泌十几种脂肽抗生素等抗真菌活性物质，主要有抗真菌蛋白、表面活性素等，这些分泌物与病毒的脂质膜发生物理化学交互作用，破坏膜结构，导致有害病菌细胞内溶物的释放而最终引起细胞死亡，能有效抑制植物病原真菌活性并且抑菌作用强烈，还能抑制核盘菌菌核萌发并抑制其菌丝生长。
【6】苏云金杆菌：可做微生物源低毒杀虫剂，以胃毒作用为主，该菌可产生两大类毒素，即内毒素（伴胞晶体）和外毒素，使害虫停止取食，最后害虫因饥饿和细胞壁破裂、血液败坏和神经中毒而死亡。
【7】胶质芽孢杆菌：能够产生碳酸酐酶，对二氧化碳的固定具有一定的作用。目前，这类细菌是用作生物肥料的最好菌种，以促进土壤无效磷钾的转化，增加土壤磷钾的供给，提高作物产量，其胶质芽孢杆菌解磷、解钾、解硅的强度超强。
