荷花越冬的最适宜温度为3-12℃。南方地区一般无需保护荷花就能露地越冬，而北方则应采取一定的保护措施。少量缸盆栽者，可移至不结冰的冷室连盆堆放，只需保持盆土湿润即可。北京北海公园是将全缸投入湖中深水处，翌春再抬上来。此法颇安全，但费人工，劳动强度亦大。济南和包头市园林科研所都是于冬季将缸荷的藕整支取出，入窖(温度3-10℃)置于缸内堆放。济南人于缸内盖草或缸中填泥覆盖，并保持湿润。包头人则在缸内将藕种与泥沙分层堆放，两地均可达到90％以上的保存率。

霜降后，剪除茎秆，盆中加满水。长江以南露地越冬，黄淮地区，用双层塑料薄膜原地覆盖。东北、西北地区，盆上盖一层塑料膜，膜上盖土，土上再盖一层塑料膜，或原盆移到塑料大棚内，春暖后翻盆分藕，每盆有新藕3-4枝，重新栽植。